O curso de medicina da Unisinos se caracteriza por apresentar um currículo inovador em educação médica, integrando a tradição Jesuíta de uma grande Universidade à alta tecnologia diagnóstica aplicada no processo de ensino-aprendizagem. Segue as últimas diretrizes curriculares para cursos de medicina, fazendo uso de estratégias pedagógicas que estimulam o protagonismo e a autonomia do aluno Prioriza a formação médica a partir da inserção precoce nos cenários de prática regionais, prevendo um trabalho interprofissional, formando médicos que considerem a integralidade do sujeito que é o centro do processo de atenção à saúde.

A centralidade dos processos de ensino-aprendizagem baseada em Programas de Aprendizagem e nos cenários de prática desde o início do Curso inverte a lógica da assistência em saúde, oferendo uma formação que enfatiza a atenção primária e atenção secundária em saúde, sua complexidade e importância além de seus princípios orientadores, sem negligenciar conhecimentos importantes em áreas de especialidades com maior concentração de tecnologia, mas atrelando-as a relações humanas de qualidade entre profissionais e usuários dos serviços no processo de atenção.

A universidade conta com modernos equipamentos de ultrassonografia, também chamada de ecografia portátil à beira do leito. Essa, possivelmente é a ferramenta médica mais importante do século XXI e o único avanço tecnológico significativo para a arte do exame físico desde a invenção do estetoscópio.